<div dir="ltr">Hola a todos,<br><br>Les comparto que he extraído una tabla demográfica para la aplicación de UKB 2964, por si alguno está interesado en trabajar con estos datos. <div><br></div><div>La tabla la encontrarán en: /mnt/cephfs/home/bio/shared/database/UKBiobank/Covariates/demographics_all_UKBB_2964_300125.tsv. También he puesto dentro de esta carpeta el excel actualizado 'lista_variables_UKB_v3_JM_2964', en el que he añadido varios códigos de mi interés y que incluí en la tabla anterior.</div><div><br>ps: He agregado el script para extracción de covariables que Lalo modificó al github.<br><br>Saludos,<br>Josseline</div></div><br><div class="gmail_quote gmail_quote_container"><div dir="ltr" class="gmail_attr">El jue, 9 ene 2025 a las 15:11, Julia Ramírez (<<a href="mailto:Julia.Ramirez@unizar.es">Julia.Ramirez@unizar.es</a>>) escribió:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><u></u>

  
    
  
  <div>
    <p>Perfecto chicos,</p>
    <p>Muchísimas gracias,</p>
    Julia
    <p></p>
    <div>On 09/01/2025 14:48, Ángela Hernández
      Mendoza wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite">
      
      <div dir="ltr">Buenos días a todos,
        <div><br>
        </div>
        <div>Este email es para informaros sobre los nuevos archivos que
          han sido subidos al clúster en relación a los datos de
          UKBiobank, en concreto a la
          carpeta /mnt/cephfs/home/bio/shared/database/UKBiobank/Covariates/.</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>En esta carpeta, podréis encontrar los siguientes archivos:<br>
          <br>
          (1) <b>Tabla máster con variables demográficas</b> de
          nuestro interés, para todos los sujetos, en las 4 visitas y
          todas las instancias disponibles. Esta tabla tiene el nombre
          de: <u>demographics_all_filtered_250109.tsv.gz. </u></div>
        <div>En ella, podéis encontrar una fila por cada sujeto incluido
          en la aplicación 8256, es decir, un total de 502 131 sujetos
          únicos (¡OJO! En esta tabla ya han sido excluidos los sujetos
          que han solicitado dejar de formar parte de la base de datos
          de UKB). En cada columna se recoge cada variable
          demográfica según su código, diferenciando el número de la
          visita con la letra i (son 4 visitas en total, pero se
          contabilizan desde 0 hasta 3) y la instancia (misma medida
          realizada varias veces en una misma visita), denominada con la
          letra a. </div>
        <div><br>
        </div>
        <div>(2) <b>Jupyter notebook para extracción de tablas del RAP</b>.
          Este script tiene el nombre de: <u>extract_covar_ukbb_250109.ipynb. </u></div>
        <div>Este cuaderno consiste en un script (originalmente creado
          por Julia y posteriormente editado por Josseline) que hemos
          editado Lalo y yo para que tan solo realice la tarea de
          extracción de variables de interés a partir un archivo *.txt
          en el que se introducen a mano los código del Showcase de UKB
          que nos interesen. Este cuaderno está preparado para no
          necesitar ser editado y no realiza ningún filtrado posterior
          de los datos. </div>
        <div><br>
        </div>
        <div>(3) <b>Listado de códigos</b> de las variables de interés
          (mencionado anteriormente). Este listado tiene el nombre de: <u>code_fields.txt. </u></div>
        <div>En este listado se incluyen los códigos de las variables
          que a día de hoy nos interesan, pero podría modificarse en el
          futuro cuando existan otras variables de interés y necesite
          ejecutarse el notebook en el RAP de nuevo. </div>
        <div><br>
        </div>
        <div>(4) Archivo de excel con la <b>descripción de los códigos</b>
          de las variables de interés. Este archivo tiene el nombre de: <u>lista_variables_UKB_v3.xlsx. </u></div>
        <div>En este archivo se recogen los distintos códigos (obtenidos
          a partir del Showcase de UKBiobank) que a día de hoy interesan
          a nivel grupal. Este es un archivo de consulta para conocer
          rápidamente qué significan las columnas de la Tabla máster. </div>
        <div><br>
        </div>
        <div>(5) Un <b><u>README.txt</u> </b>donde se recoge de forma
          resumida lo comentado en las líneas anteriores. </div>
        <div><br>
        </div>
        <div>Espero haberme explicado de la mejor manera posible,
          cualquier consulta no dudéis en comentarnos. </div>
        <div><br>
        </div>
        <div>Un abrazo,</div>
        <div>Ángela</div>
        <div><br>
        </div>
        <div><br>
        </div>
        <div><br>
        </div>
        <div><br>
        </div>
      </div>
      <br>
      <fieldset></fieldset>
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