<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-size:large"><br>Dear Gordana, et al,<br><br>< But then one may ask: what must a physical system be such that it can act on its own behalf? . . . minimal molecular autonomous agent: such a system . . . ><br><br>Indeed!<br>Interestingly, this ties my 1 January post, just beforee this FIS session – in response to Jerry’s 31 December note, which oddly does not show in the FIS archive (but is now copied below, in addition to Jorge’s note).<br><br>To me, your five points seem to define 'agency’, where the language of your post may suggest something more-reductive (molecular): ’proto-agency’ – is THAT your meaning?!<br><br>Forgive me if I seem to 'twist’ your meaning (not intended) . . . but such proto-agency is what I tried to evoke as most-base 'adaptive logic’ . . . where simple mechanical preservation of base molecular form would initiate adaptive logic. That base molecular/mechanical self-preserved 'form’ might then serve as *one* constituent in fully realized agency. Following Jorge’s note, my view was more 'engineering’ in nature, as a most-base mechanical Life/agent precursor. <br><br>Regardless, our interests may be parallel, alongside Stuart and Andrea’s argued-for 'transition in science' . . . where I have raised related points (re function, and selection) in another post. But I see all here as related . . . in targeting a 'New Kind of Science' (with apologies to S. Wolfram).<br><br>Marcus<br><br>==<br>Dear colleagues,<br> <br>Allow me to propose one more facet of life that adds to the central theme of Kantian Wholes: autonomous agency. Living organisms are "agential" materials, as Michael Levin puts it. They possess cognition, have agendas, and act purposefully.<br>This is how agency is explained by Stu in [1], and similarly in [2]:<br> <br>"It is a stunning fact that the universe has given rise to entities that daily modify the universe to suit their own ends. We call this capacity 'agency' — the ability to act on one's own behalf."<br> <br>But then one may ask: what must a physical system be such that it can act on its own behalf?<br>We propose a tentative five-part definition of a minimal molecular autonomous agent: such a system<br>should be capable of reproduction with heritable variation,<br>should perform at least one work cycle and have boundaries such that it<br>can be naturally individuated,<br>should engage in self-propagating work and constraint construction, and<br>should be able to choose between at least two alternatives.<br> <br>(I reformatted the sentence into the numbered list).<br> <br>References:<br>[1] Kauffman, S., Clayton, P. On emergence, agency, and organization. Biol Philos 21, 501–521 (2006). <a href="https://urldefense.com/v3/__https://doi.org/10.1007/s10539-005-9003-9__;!!D9dNQwwGXtA!SFiPfluDUt8NVoQoyroMtkFBZ28IYbJ9T_0hDLKdir2Pj6qF8YdDDbifPgSqJUbUYL94IqCyAoZ0Zzel$">https://doi.org/10.1007/s10539-005-9003-9</a><br>[2] Kauffman, S.A. The origins of order: Self-organization and selection in evolution. New York: Oxford University Press, 1996.<br> <br>To the above definition of agency of a minimal molecular autonomous agent, I would propose to add information processing which enables learning and adaptation.<br> <br>It appears to me that points 1, 3, 4, and 5 above derive from the information processing capacity of these systems.<br>Goal-directedness, or agency, can be seen as based on information processing, which is enabled by memory and the mechanism of anticipation that is contingent on memory.<br> <br>Evolutionarily, all cognitive (agential) mechanisms derive from material characteristics. As an illustration, see a very short account in the video The Biophysics of a Brainless Animal.
More extended explanation can be found at:
<a href="https://urldefense.com/v3/__https://www.youtube.com/watch?v=O1VAIwcn7z8__;!!D9dNQwwGXtA!SFiPfluDUt8NVoQoyroMtkFBZ28IYbJ9T_0hDLKdir2Pj6qF8YdDDbifPgSqJUbUYL94IqCyAjSPQ0xM$">https://www.youtube.com/watch?v=O1VAIwcn7z8</a> Manu Prakash: The physics of biology, which addresses several of Stu’s questions.<br> <br>Gordana<br><br>==<br>from Jerry –<br><br>Marcus, List:<br><br>After reading your post, it is unclear what question you are asking.  Three questions come to mind.<br>Is the issue the existence of a dividing line or threshold between the atomic sciences and the life sciences?<br>Or, is the question about the organization of matter such that intelligence (life) a consequence entailed by structural information?<br>Or, does the question refer to the cognitive structures of “intelligent objects” ascribed to internal forms?<br><br>Recalling the recent FIS discussions on the virus, TMV, tobacco mosaic virus, a crystalline form of biological organized atoms, I am wondering if that distinction would provide some guidance on the intended meaning of “adaptive logic”.<br><br>Also, it would be informative if one knew what form of logic you are referring to - classical, intuitive, modal, etc which are abstractions without direct reference to scientific terms or natural logics (deployed by Mother Nature to get the job done.)<br><br>I think your questions are most appropriate here, given the history of the discussions grasping for a semantic/syntactical thread to tie the various hypotheses together.  (As if the inquiry is seeking some form of “modus operandi” to match or pair with “modus ponens”. :-). )<br><br>CheersJerryHappy New Year to All!!!<br><br>==<br>from Jorge–<br><br>Hi Marcus,I am an engineer by training. The “reverse engineering” of both kind of systems would help.Greetings,Jorge <table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="margin:0px;padding:0px;border:0px;outline:0px;font-size:14px;font-family:proxima-nova-1,proxima-nova-2,Tahoma,Helvetica,Verdana,sans-serif;vertical-align:baseline;border-spacing:0px;color:rgb(51,51,51);line-height:18px"><tbody style="margin:0px;padding:0px;border:0px;outline:0px;font-style:inherit;font-family:inherit;vertical-align:baseline"><tr style="margin:0px;padding:0px;border:0px;outline:0px;font-style:inherit;font-family:inherit;vertical-align:baseline"><td style="padding:0px;border:0px;outline:0px;font-style:inherit;font-size:0px;font-family:inherit;vertical-align:baseline;width:auto;height:30px"></td></tr><tr style="margin:0px;padding:0px;border:0px;outline:0px;font-style:inherit;font-family:inherit;vertical-align:baseline"><td style="padding:0px;border:0px;outline:0px;font-style:inherit;font-family:inherit;vertical-align:baseline;width:auto"></td></tr><tr style="margin:0px;padding:0px;border:0px;outline:0px;font-style:inherit;font-family:inherit;vertical-align:baseline"></tr></tbody></table></div></div>