<html>
  <head>
    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8">
  </head>
  <body>
    <div class="moz-cite-prefix">Dear All,</div>
    <div class="moz-cite-prefix"><br>
    </div>
    <div class="moz-cite-prefix">As the discussion is getting more
      complex, I can only give a couple of brief responses to the issues
      raised by Lou and Jerry (I agree with Joseph's comments and
      appreciate them). Responding first to Lou, indeed <i>distinctions</i>
      are a fundamental issue, also in the bioinformation world.
      Actually I have been considering --these last two decades or so--
      that for living agents information appears as "distinction on the
      adjacent". Expressing distinctions as a result of recursion is new
      for me: I was following Karl's partitions, and was much interested
      in his notion of a limited number of multidimensional partitions
      depending on set size. This alternative (or complementary)
      recursive conceptualization can also be very interesting regarding
      two biological approaches I was recently intrigued with: the work
      on the emergence of syntax/meaning in the RNA sequences world by
      Witzany's, and in the algorithmic challenge of vertebrate immune
      systems having to distinguish between self and non-self--in a true
      Godelian puzzle (ongoing work by Sheri Markose). Probably the
      latter would accept presenting in our list. If there are
      expressions of interest I could tell her.</div>
    <div class="moz-cite-prefix"><br>
    </div>
    <div class="moz-cite-prefix">And about Jerry's eleven paragraphs, I
      am afraid that such general questions may open excessively the
      discussion. Somehow, I was reminded of some past Century
      philosophers: Ortega y Gasset, Merleau-Ponty, and A.N. Whitehead.
      I am more familiar with the former --his "perspectivism". My
      personal translation is the "doctrine of limitation". Given the
      iron-limits of our cognition, every scientific approach becomes
      limited, specialized, and forced to multidisciplinary dialog. This
      rubbing among disciplines is a potent recombination engine that
      creates and destroys models, paradigms, and even entire fields.
      So, disciplines of natural science are not only
      formal/experimental constructs, but also social-historical bodies
      with singular idiosyncratic trajectories. Just looking at this
      very list we can watch what has happened with information
      discussions in last decades...   Well, this is an indirect
      response. to Jerry's well crafted points and I would need more
      time to make a decent criticism. <br>
    </div>
    <div class="moz-cite-prefix"><br>
    </div>
    <div class="moz-cite-prefix">Finally, going back to codes, maybe
      they are the inner "constraints" to vehiculate the external
      information flows, versus the internal ones, so that the former
      are conveniently matched, processed, and solved. Talking in terms
      of "intelligence", both the natural intelligence  of biological
      systems and the artificial intelligence of computer systems cannot
      handle their respective external information flows except by
      relying on a multitude of multi-level channeling codes. (??)<br>
    </div>
    <div class="moz-cite-prefix"><br>
    </div>
    <div class="moz-cite-prefix">Best regards,</div>
    <div class="moz-cite-prefix">--Pedro<br>
    </div>
    <div class="moz-cite-prefix"><br>
    </div>
    <div class="moz-cite-prefix">in the way El 27/09/2021 a las 19:34,
      Jerry LR Chandler escribió:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite"
      cite="mid:A1B9DDD1-CA7D-40BF-8A39-640305643382@icloud.com">
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8">
      Pedro, List:  <br class="">
      <div>
        <blockquote type="cite" class=""><br
            class="Apple-interchange-newline">
          <div class="">
            <blockquote type="cite" class="" style="font-family:
              Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal;
              font-variant-caps: normal; font-weight: normal;
              letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start;
              text-indent: 0px; text-transform: none; white-space:
              normal; widows: auto; word-spacing: 0px;
              -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width:
              0px; text-decoration: none;">
              <div class="">
                <div class="">
                  <div class="moz-cite-prefix">So, there are formal,
                    logical, philosophical, semiotic arguments to make
                    about codes--OK, but if they do not consider this
                    real world aspect of heterogeneity of processing
                    architectures am afraid they will be of limited
                    usefulness to approach the reliance of computers and
                    living beings on codes.</div>
                  <div class="moz-cite-prefix"><br class="">
                  </div>
                  <div class="moz-cite-prefix">Best regards,</div>
                  <div class="moz-cite-prefix">--Pedro<span
                      class="Apple-converted-space"> </span><br class="">
                  </div>
                </div>
              </div>
            </blockquote>
            <br class="Apple-interchange-newline">
          </div>
        </blockquote>
      </div>
      <br class="">
      <div style="font-size: 16px;" class="">This sentence, in my
        mathematical judgement, gets to the essence of communication of
        artificial actions within humanity as a whole by using
        artificial symbol systems to create meaning that is informed by
        the intentions of the communicator with respect the capacities
        of potential receivers. </div>
      <div style="font-size: 16px;" class=""><br class="">
      </div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">In short, mathematics
        itself is merely one of the multitude of synthetic symbol
        systems that have emerged as a critical component of human
        cultures. </div>
      <div style="font-size: 16px;" class=""><br class="">
      </div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">The role of mathematics in
        human cultures started at least 4 millennia BC and has continued
        to grow.  </div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">The parallel role of a
        second synthetic symbol representing<b class=""> sounds</b>,
        alphabets and other alphabet-like encoding systems, lead to
        methods to record human history, human emotions, humans desires
        for the future (planning and philosophies of actions, such as
        anticipation.)</div>
      <div style="font-size: 16px;" class=""><br class="">
      </div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">Pedro, your brilliant
        sentence captures the very essence, in my opinion, of the
        central issue that is overlooked in most of the FIS exchanges
        because it<b class=""> identifies</b> the common source of the
        diverse assertions that separate the meanings of the assertions
        to different recipients. </div>
      <div style="font-size: 16px;" class=""><br class="">
      </div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">The “lingua franca” of this
        List Serve is a theory of mathematically grounded “messages”,
        augmented with symbols for sounds.  One might even conjecture
        that if we all had a <b class="">homogeneous</b> understanding
        of how these iconic forms are understood, such as mathematical
        category theory, we would have complete foundation for the
        foundations of the information sciences!  </div>
      <div style="font-size: 16px;" class=""><br class="">
      </div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">As you so adroitly point
        out, Pedro, the <b class="">heterogenous</b> membership
        understand that symbol systems <b class="">other than
          mathematics and alphabets</b> are used in the natural sciences
        and natural philosophy to communicate information between
        participants of this list. [" formal, logical, philosophical,
        semiotic arguments to make about code”]</div>
      <div style="font-size: 16px;" class=""><br class="">
      </div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">Why?</div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">Why are heterogenous symbol
        systems used in scientific communications about nature?</div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">Historically, how have the
        multitude of symbol systems emerged from alphabets and
        mathematics?</div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">How are these emergent
        properties of symbol systems used in the pragmatic work of the
        natural scientists?</div>
      <div style="font-size: 16px;" class=""><br class="">
      </div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">The philosophy of science
        of physics embraces the mathematical symbol system and asserts
        that all logical natural truths can be expressed in this
        language (Galileo). This philosophy has been embraced by many
        FIS contributors and grounds linguistically the forms of the
        encoded messages of both agreement and disagreement.  The focus
        of the disagreements tend to be limited to such
        mathematical/physical terms, as entropy, excluded middle, number
        sequences, and meanings of formal logical terminology.</div>
      <div style="font-size: 16px;" class=""><br class="">
      </div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">The philosophy of the
        natural sciences rests on the pragmaticisms. Natural scientists
        assign meaning to semantic terms in order to identity the
        objects of nature understudy. To this end, natural scientists
        (including physicians) assign direct one to one correspondence
        relationships between semantic terms and sensory experiences (in
        addition to sensory experiences of sight and sound used for
        mathematical symbolic communications), other sensory
        experiences, such as smell, taste, touch, temperature, pressure,
        and intuitive feelings (for example, the touch of a loved one)
        are routinely used. </div>
      <div style="font-size: 16px;" class=""><br class="">
      </div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">In short, the ontology and
        epistemology of the symbolic forms of human symbolic codes
        extend far beyond narrow boundaries of the meanings of
        theological terms associated with the logics of mathematics and
        physics.  </div>
      <div style="font-size: 16px;" class=""><br class="">
      </div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">In closing, Pedro I would
        pose a singular interrogative.</div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">Do these eleven paragraphs,
        taken as a whole, capture the essence of your intended meaning
        of the sentence quoted at the beginning of this message? My
        premise would be that in the conceptual architecture of my
        pragmatic use of codes and symbols in these brief paragraphs, I
        probably missed certain critical features of your intended
        meaning.  Can you (or other readers) flag the multiplicity of
        defects?</div>
      <div style="font-size: 16px;" class=""><br class="">
      </div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">If so, you can move the
        conversation forward and expand on these concepts from your
        particular arithmetical, heterogenic, psychological, referential
        philosophy of communication (and also information) by either
        augmenting or rejecting parts of the architectures this semantic
        encoding of meanings of symbolic codes. </div>
      <div style="font-size: 16px;" class=""><br class="">
      </div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">Cheers</div>
      <div style="font-size: 16px;" class=""><br class="">
      </div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">Jerry </div>
      <div style="font-size: 16px;" class=""><br class="">
      </div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">Research Professor</div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">Krasnow Institute for
        Advanced Study</div>
      <div style="font-size: 16px;" class=""><br class="">
      </div>
      <div style="font-size: 16px;" class="">(BTW, the philosophical
        roots of the modern notions of the concepts of evolutionary
        emergences of symbolic differences that encode differences can
        be associated with the terms introduced by philosopher, C S
        Mills, heteropathy ca 1843) </div>
      <div style="font-size: 16px;" class=""><br class="">
      </div>
      <div style="font-size: 16px;" class=""><br class="">
      </div>
      <div style="font-size: 16px;" class=""><br class="">
      </div>
    </blockquote>
    <p><br>
    </p>
    <pre class="moz-signature" cols="72">-- 
-------------------------------------------------
Pedro C. Marijuán
Grupo de Bioinformación / Bioinformation Group

<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:pcmarijuan.iacs@aragon.es">pcmarijuan.iacs@aragon.es</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://sites.google.com/site/pedrocmarijuan/">http://sites.google.com/site/pedrocmarijuan/</a>
-------------------------------------------------</pre>
  <div id="DAB4FAD8-2DD7-40BB-A1B8-4E2AA1F9FDF2"><br /> <table style="border-top: 1px solid #D3D4DE;">
        <tr>
      <td style="width: 55px; padding-top: 18px;"><a href="https://www.avast.com/sig-email?utm_medium=email&utm_source=link&utm_campaign=sig-email&utm_content=emailclient" target="_blank"><img src="https://ipmcdn.avast.com/images/icons/icon-envelope-tick-round-orange-animated-no-repeat-v1.gif" alt="" width="46" height="29" style="width: 46px; height: 29px;" /></a></td>
                <td style="width: 470px; padding-top: 17px; color: #41424e; font-size: 13px; font-family: Arial, Helvetica, sans-serif; line-height: 18px;">Libre de virus. <a href="https://www.avast.com/sig-email?utm_medium=email&utm_source=link&utm_campaign=sig-email&utm_content=emailclient" target="_blank" style="color: #4453ea;">www.avast.com</a>           </td>
        </tr>
</table>
<a href="#DAB4FAD8-2DD7-40BB-A1B8-4E2AA1F9FDF2" width="1" height="1"> </a></div></body>
</html>