<div dir="ltr">  Pedro -- Regarding entropy definitions in respect to information, I have found it useful to consider that what in Information Theory <div>is often/typically <span style="line-height:1.5">referred to as 'information' ought, instead, to be referred to as 'information carrying </span>capacity<span style="line-height:1.5">', while a sample taken </span></div><div><span style="line-height:1.5">from this would then be 'information' neat. In other words, any system we encounter will have a capacity to deliver information upon</span></div><div><span style="line-height:1.5">investigation. </span></div><div><span style="line-height:1.5">STAN</span></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Jan 18, 2021 at 6:32 AM Arieh Ben-Naim <<a href="mailto:ariehbennaim@gmail.com">ariehbennaim@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">Dear Pedro,<div>Sorry  for the long delay in my answer.</div><div>I will answer briefly since a long answer would take too much time and space.</div><div>1. I fully agree that entropy and SMI should be given different names. The fact that Shannon called his measure ( the SMI ) entropy, was a grave mistake.</div><div>This has caused great confusion in both thermodynamics and information theory. ( confusing entropy with SMI and SMI with “information” is very common)</div><div>2. I agree that in some specific processes the entropy change may be associated with increase in “freedom” or with “spreading.” </div><div>This is also true for “disorder” however, none of these interpretations can be derived from the definition of entropy. So, in general, they are not correct interpretation of entropy.</div><div>3.  Of course the Gibbs energy is the quantity which is more fundamental in a system at constant T and P. The formulation of the second law in terms of entropy is valid only for isolated systems.</div><div>Best wishes</div><div>Arieh</div><div><br>On Wednesday, January 13, 2021, Pedro C. Marijuan <<a href="mailto:pcmarijuan.iacs@aragon.es" target="_blank">pcmarijuan.iacs@aragon.es</a>> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
  
    
  
  <div>
    <div>Dear Arieh and FIS Colleagues,</div>
    <div><br>
    </div>
    <div>Again, regarding the interpretation of
      entropy as information or uncertainty (respect locations &
      momenta), my suggestion is that we should call "something else" to
      the extensive magnitude we are measuring. Otherwise, we easily
      give room to all those pseudo-interpretations you wonderfully
      describe and the general confusion with information. When I was
      teaching a bio-discipline for engineer students, I was using the
      term "freedom". You are measuring the degrees of freedom of the
      system, I was telling, how much they have changed either
      increasing or decreasing along the process. And that quantity of
      degrees of freedom when multiplied by the temperature gives the
      energy gained or lost via entropy change. So, the application of
      SMI to the system what tells us is about the degrees of freedom
      statistical measurement. In short: the new freedom status of the
      system. It may not be a terrific theoretical interpretation, but
      my students loved it (I confess that previously I was using
      Lambert's "dispersal", until I saw your criticisms in the web).</div>
    <div><br>
    </div>
    <div>All of this is well depicted in Gibbs'
      formula for the free energy of chemical reactions, with the part
      due to ENTHALPY change (basically internal energy), and the part
      due to ENTROPY change x Temp. Given than most biological --all!--
      occur to room temperature (or far lower), the resulting
      contribution of entropy is pretty moderate. Actually I was
      checking chemical tables of many biological reactions, and the
      contribution of entropy was generally an order of magnitude lower
      than enthalpy--around 10% or less. I wonder --following Howard's
      comment days ago-- all the obsession with entropy and the
      universal neglect of enthalpy. It is enthalpy (or internal energy,
      or free energy) the big concern of all biological systems, "the
      food of today", rather than the negentropy or low entropy you
      graciously comment. <br>
    </div>
    <div><br>
    </div>
    <div>I had also a comment regarding Joseph's
      and Jerry's on Pauli Exclusion Principle, but better for another
      day.</div>
    <div><br>
    </div>
    <div>Best wishes to all--Pedro<br>
    </div>
    <div><br>
    </div>
    <div>El 08/01/2021 a las 19:22, Arieh
      Ben-Naim escribió:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite">
      
      <div>
        <div dir="auto">Dear Pedro and everyone else interested.</div>
        <div dir="auto"><br>
        </div>
        <div dir="auto">I will briefly answer your questions, as I have
          discussed these in more details in my previews publications.</div>
        <div dir="auto">Regarding the interpretation of entropy as a
          measure of information and as uncertainty.</div>
        <div dir="auto">In my view these are the only valid
          interpretations of entropy, provided that one specifies
          information about what, and uncertainty with respect to what.
          Both of these are discussed in my book on “Information Theory”
          and in “Entropy: the Greatest Blunder in the History of
          Science.”</div>
        <div dir="auto"><br>
        </div>
        <div dir="auto">Regarding the question of dimensions for
          entropy, I have also discussed that in my book on “Farewell to
          Entropy.”</div>
        <div dir="auto">In my view this is a result of historical
          “accident” that temperature was given a special dimensions
          that were not used before in physics:”degrees” </div>
        <div dir="auto">If temperature was given the dimensions of
          energy, then entropy would become dimensionless. This would
          ease the acceptance of the only correct interpretation of
          entropy either as a measure of information or a measure of
          uncertainty (in both cases the information and uncertainty
          with respect to the distribution of locations and momenta of
          all particles of the system at equilibrium)</div>
        <div dir="auto"><br>
        </div>
        <div dir="auto">In my recent book I have criticized both
          Shermer’s and Pinker’s misuses of the concept of entropy in
          their books.</div>
        <div dir="auto"><br>
        </div>
        <div dir="auto">I hope I have answered your questions, though
          very briefly.</div>
        <div dir="auto">Best regards</div>
        <div dir="auto">Arieh</div>
        <br>
        <div class="gmail_quote">
          <div>On Fri, Jan 8, 2021 at 15:40 Pedro C. Marijuan <<a href="mailto:pcmarijuan.iacs@aragon.es" target="_blank">pcmarijuan.iacs@aragon.es</a>>
            wrote:<br>
          </div>
          <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">Dear Arieh
            & FISers,<br>
            <br>
            My appreciation for your elegant and lively contribution.
            Reading about <br>
            labeling the food on their "negentropy content"  or advising
            on low <br>
            entropy food (icy water!) was a most humorous way to
            criticize all the <br>
            nonsense and "mystical mystery tours" around entropy.
            Particularly, <br>
            Atkins (& Dawkins) quasi-religious views have always
            been unswallowable <br>
            for me. Anyhow, two further aspects I would like to hear
            from you.<br>
            <br>
            First, to put it most briefly, what basic, visual image
            would you convey <br>
            for an intuitive understanding of entropy beyond the
            technicality of <br>
            SMI? Uncertainty, chaos, disorder, diffusion, dispersal...
            some many <br>
            terms around!  I could see years ago some heated exchanges
            you had with <br>
            Frank Lambert, the champion of entropy as energy dispersal.
            There is <br>
            also a longish comment on how Steven Pinker approaches <br>
            entropy-information-evolution-cognition as the four
            fundamental concepts <br>
            in our scientific understanding of the world. He is wrong
            (IMO) in all <br>
            of them! Although it he is an extraordinary social
            psychologist the <br>
            basic sci. background he proposes is tainted. If we could
            give a more <br>
            sound "tetrad" even with those same concepts, it would be a
            great <br>
            outcome. Clarifying entropy in all aspects we could advance
            would a <br>
            terrific step.<br>
            <br>
            And second (maybe to be discussed later on) do you accept
            "dimensions" <br>
            for entropy? The units of jules/degreeK aren't they derived
            from having <br>
            entered the Boltzmann's constant? Why do we need at all
            separate units <br>
            for temperature and energy?<br>
            <br>
            Thanks for all the exchanges so far!<br>
            <br>
            Best--Pedro<br>
            <br>
            -- <br>
            -------------------------------------------------<br>
            Pedro C. Marijuán<br>
            Grupo de Bioinformación / Bioinformation Group<br>
            <br>
            <a href="mailto:pcmarijuan.iacs@aragon.es" target="_blank">pcmarijuan.iacs@aragon.es</a><br>
            <a href="http://sites.google.com/site/pedrocmarijuan/" rel="noreferrer" target="_blank">http://sites.google.com/site/pedrocmarijuan/</a><br>
            -------------------------------------------------<br>
            <br>
            <br>
            -- <br>
            El software de antivirus Avast ha analizado este correo
            electrónico en busca de virus.<br>
            <a href="https://www.avast.com/antivirus" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.avast.com/antivirus</a><br>
            <br>
            _______________________________________________<br>
            Fis mailing list<br>
            <a href="mailto:Fis@listas.unizar.es" target="_blank">Fis@listas.unizar.es</a><br>
            <a href="http://listas.unizar.es/cgi-bin/mailman/listinfo/fis" rel="noreferrer" target="_blank">http://listas.unizar.es/cgi-bin/mailman/listinfo/fis</a><br>
            ----------<br>
            INFORMACIN SOBRE PROTECCIN DE DATOS DE CARCTER PERSONAL<br>
            <br>
            Ud. recibe este correo por pertenecer a una lista de correo
            gestionada por la Universidad de Zaragoza.<br>
            Puede encontrar toda la informacin sobre como tratamos sus
            datos en el siguiente enlace: <a href="https://sicuz.unizar.es/informacion-sobre-proteccion-de-datos-de-caracter-personal-en-listas" rel="noreferrer" target="_blank">https://sicuz.unizar.es/informacion-sobre-proteccion-de-datos-de-caracter-personal-en-listas</a><br>
            Recuerde que si est suscrito a una lista voluntaria Ud.
            puede darse de baja desde la propia aplicacin en el momento
            en que lo desee.<br>
            <a href="http://listas.unizar.es" rel="noreferrer" target="_blank">http://listas.unizar.es</a><br>
            ----------<br>
          </blockquote>
        </div>
      </div>
      -- <br>
      <div dir="ltr">Prof. Arieh Ben-Naim<br>
        Department of Physical Chemistry<br>
        The Hebrew University of Jerusalem<br>
        Jerusalem, 91904<br>
        Israel</div>
      <br>
      <fieldset></fieldset>
      <pre>_______________________________________________
Fis mailing list
<a href="mailto:Fis@listas.unizar.es" target="_blank">Fis@listas.unizar.es</a>
<a href="http://listas.unizar.es/cgi-bin/mailman/listinfo/fis" target="_blank">http://listas.unizar.es/cgi-bin/mailman/listinfo/fis</a>
----------
INFORMACIÓN SOBRE PROTECCIÓN DE DATOS DE CARÁCTER PERSONAL

Ud. recibe este correo por pertenecer a una lista de correo gestionada por la Universidad de Zaragoza.
Puede encontrar toda la información sobre como tratamos sus datos en el siguiente enlace: <a href="https://sicuz.unizar.es/informacion-sobre-proteccion-de-datos-de-caracter-personal-en-listas" target="_blank">https://sicuz.unizar.es/informacion-sobre-proteccion-de-datos-de-caracter-personal-en-listas</a>
Recuerde que si está suscrito a una lista voluntaria Ud. puede darse de baja desde la propia aplicación en el momento en que lo desee.
<a href="http://listas.unizar.es" target="_blank">http://listas.unizar.es</a>
----------
</pre>
    </blockquote>
    <p><br>
    </p>
    <pre cols="72">-- 
-------------------------------------------------
Pedro C. Marijuán
Grupo de Bioinformación / Bioinformation Group

<a href="mailto:pcmarijuan.iacs@aragon.es" target="_blank">pcmarijuan.iacs@aragon.es</a>
<a href="http://sites.google.com/site/pedrocmarijuan/" target="_blank">http://sites.google.com/site/pedrocmarijuan/</a>
------------------------------------------------- </pre>
  <div><br> <table style="border-top-width:1px;border-top-style:solid;border-top-color:rgb(211,212,222)">
        <tbody><tr>
      <td style="width:55px;padding-top:18px"><a href="https://www.avast.com/sig-email?utm_medium=email&utm_source=link&utm_campaign=sig-email&utm_content=emailclient" target="_blank"><img src="https://ipmcdn.avast.com/images/icons/icon-envelope-tick-round-orange-animated-no-repeat-v1.gif" alt="" width="46" height="29" style="width: 46px; height: 29px;"></a></td>
                <td style="width:470px;padding-top:17px;color:rgb(65,66,78);font-size:13px;font-family:Arial,Helvetica,sans-serif;line-height:18px">Libre de virus. <a href="https://www.avast.com/sig-email?utm_medium=email&utm_source=link&utm_campaign=sig-email&utm_content=emailclient" style="color:rgb(68,83,234)" target="_blank">www.avast.com</a>              </td>
        </tr>
</tbody></table>
<a href="#m_7084316037359452892_m_-2797674480543180183_DAB4FAD8-2DD7-40BB-A1B8-4E2AA1F9FDF2" width="1" height="1"> </a></div></div>

</blockquote></div><br><br>-- <br>Prof. Arieh Ben-Naim<br>Department of Physical Chemistry<br>The Hebrew University of Jerusalem<br>Jerusalem, 91904<br>Israel<br>
_______________________________________________<br>
Fis mailing list<br>
<a href="mailto:Fis@listas.unizar.es" target="_blank">Fis@listas.unizar.es</a><br>
<a href="http://listas.unizar.es/cgi-bin/mailman/listinfo/fis" rel="noreferrer" target="_blank">http://listas.unizar.es/cgi-bin/mailman/listinfo/fis</a><br>
----------<br>
INFORMACIÓN SOBRE PROTECCIÓN DE DATOS DE CARÁCTER PERSONAL<br>
<br>
Ud. recibe este correo por pertenecer a una lista de correo gestionada por la Universidad de Zaragoza.<br>
Puede encontrar toda la información sobre como tratamos sus datos en el siguiente enlace: <a href="https://sicuz.unizar.es/informacion-sobre-proteccion-de-datos-de-caracter-personal-en-listas" rel="noreferrer" target="_blank">https://sicuz.unizar.es/informacion-sobre-proteccion-de-datos-de-caracter-personal-en-listas</a><br>
Recuerde que si está suscrito a una lista voluntaria Ud. puede darse de baja desde la propia aplicación en el momento en que lo desee.<br>
<a href="http://listas.unizar.es" rel="noreferrer" target="_blank">http://listas.unizar.es</a><br>
----------<br>
</blockquote></div>